据2013年4月日本贸易振兴机构发表的调查，日资企业在华投资共有5947家（母公司注册地在华的投资额计入中国）分布在除西藏以外的所有省级行政区、香港和澳门，主要集中于华东和沿海地区。 其中，江苏省866家、广东省699家、山东省491家位列前三名；北京有329家，排名第十。 上海有232家日资企业，仅次于江苏的532家和广东的707家，位列第三，但比第四名的天津要多出50余家。
根据该报告，制造业仍然是日资企业在中国投资最主要的领域，第二产业的投资比重高达72.4%。从具体的行业来看，日资在机械行业(含运输设备)的投资最多，达到3029家，其次为电器/通讯/电子器材业（969家）和批发零售业（928家）。
昌思言优质答主在上海，日本的经济存在可谓根深蒂固。据最新数据，在上海的日资企业接近8000家，其工业产值占全市工业总产值的20%以上，进出口额占全市近40%，利润总额超过全市40%。截至2021年9月，上海累计新增的455家跨国公司地区总部中，来自日本的有45家，几乎达到韩国、新加坡两国的总和。这些企业的存在，为上海提供了数十万稳定、高薪的就业机会，成为上海城市繁荣的重要支撑。
值得注意的是，近年来，尤其是新冠疫情暴发以来，出于成本压力、中美贸易摩擦以及疫情下产业链转移等因素的考虑，部分日企出现撤离中国的迹象。目前看来，这一浪潮尚未结束。
日企迁离中国最严重的地方是珠三角地区。由于珠三角地区缺乏配套的汽车工业及电子工业，产业以服装和玩具制鞋等轻工业为主，随着土地和人力成本的飙升，劳动密集型的日企开始转移。日立、丰田、索尼等公司纷纷宣布撤出广州、佛山、深圳等沿海城市。一些转移到越南的企业大多生产服装、玩具、家居用品、音响、游戏控制台等。
